El esquema general de funcionamiento de la estación de Annet-sur-Marne se basa en un sistema gravitatorio, sin bombeo intermedio, con lo que se minimiza el empleo de circuitos de bombeo y, en consecuencia, se reduce el nivel de ruido ambiental. La arena y el carbón utilizados en el proceso de tratamiento del agua se reciclan para su posterior reutilización. Por otro lado, la planta de Annet-sur-Marne cuenta con un nuevo sistema de tratamiento de los fangos de decantación, que actualmente son deshidratados antes de proceder a su evacuación. Antes, estos fangos eran devueltos al río Marne.